يتم التعامل مع الزكاة على الصناديق وفق النظام التالي:
احتساب الزكاة: يقوم الصندوق، بالتعاون مع المراجع المعتمد، بحساب قيمة الزكاة لكل وحدة. تُلزم بدفع الزكاة الشركات السعودية المالكة للوحدات، ويعود الأمر لتقديرها فيما يتعلق بالسداد.
حاملو الوحدات: بالنسبة للأفراد الذين يرغبون في خصم قيمة استثماراتهم من قاعدة زكاتهم الشخصية، يتعين عليهم دفع الزكاة على نصيبهم من قاعدة الزكاة التي يتم احتسابها من قبل الصندوق.
دور ستيك: لا تتولى ستيك دفع الزكاة نيابة عن المستثمرين. يُنصح المستثمرون بالتواصل مع مستشاري الزكاة أو الضرائب الخاصين بهم للحصول على التوجيه المناسب.